文波
发表时间：2020-10-27 阅读次数：6939次
文波，博士，研究员，担任科技部国家重大科学研究计划首席科学家（2015-2019），入选上海市“曙光学者”、“浦江人才”。担任中国生物化学与分子生物学学会理事、上海生物化学与分子生物学学会常务理事、上海市遗传学会理事、《中国生物化学与分子生物学学报》、《生命的化学》编委等学术任职。
教育经历
2000-2004 复旦大学遗传所 博士
1997-2000 云南大学生物系 硕士
1993-1997 云南大学生物系 学士
工作经历
2017-至今 复旦大学基础医学院 研究员
2010-2017 复旦大学生物医学研究院 研究员
2009-2010 美国霍普金斯大学医学系 讲师
2005-2009 美国霍普金斯大学 博士后
联系方式
地址：上海市东安路130号西13号楼413
电话：021-54237505
E-MAIL: bowen75@fudan.edu.cn
研究领域
1.染色质高级结构形成及维持的分子机制；
2.染色质高级结构的生理功能，及其在代谢综合征、男性不育症等疾病中的病理意义。
主要学术贡献
文波研究员主要从事人类遗传学及表观遗传学相关领域的研究，发表学术论文>40篇，被引用>6100次，H-index为23（截止2020年9月）。其中，作为第一或通讯作者在Nature（2004）、Nature Genetics（2009a, 2009b）、Molecular Cell (2020)、Genome Research（2008, 2018）等期刊发表研究型论文16篇，影响因子总计>200，被引>1780次，单篇最高被引>800次。获得全国优秀博士论文，云南省自然科学一等奖等奖项。
近五年来，课题组围绕“染色质高级结构的功能及分子机制”这一前沿科学问题进行研究，以核基质（Nuclear Matrix）、核体（Nuclear Bodies）等“非染色质组分”为切入点，揭示了多个新的染色质高级结构调控分子并阐释了其作用机制。系列研究发表于Molecular Cell（2020）、Genome Research（2018）等期刊。近五年承担国家重大科学研究计划等国家级科研项目4项，总经费2746万元。
文波研究员主要从事人类遗传学及表观遗传学相关领域的研究，发表学术论文>40篇，被引用>6100次，H-index为23（截止2020年9月）。其中，作为第一或通讯作者在Nature（2004）、Nature Genetics（2009a, 2009b）、Molecular Cell (2020)、Genome Research（2008, 2018）等期刊发表研究型论文16篇，影响因子总计>200，被引>1780次，单篇最高被引>800次。获得全国优秀博士论文，云南省自然科学一等奖等奖项。
近五年来，课题组围绕“染色质高级结构的功能及分子机制”这一前沿科学问题进行研究，以核基质（Nuclear Matrix）、核体（Nuclear Bodies）等“非染色质组分”为切入点，揭示了多个新的染色质高级结构调控分子并阐释了其作用机制。系列研究发表于Molecular Cell（2020）、Genome Research（2018）等期刊。近五年承担国家重大科学研究计划等国家级科研项目4项，总经费2746万元。
基金项目
1. 2011.1-2013.12国家基金委重大研究计划/培育项目：“胚胎干细胞定向分化中大片段异染色质修饰的全基因组动态及"上锁"假说”，60万元
2. 2011.1-2015.12973计划重大科学问题导向项目：“非编码RNA在干细胞命运调控中的功能及分子机制”，230万元
3. 2014.1-2017.12国自然面上项目：“小鼠胚胎干细胞定向分化中异染色质域与核纤层的相互作用”，90万元
4. 2015.1-2019.8国家重大科学研究计划（S-973）：“长非编码RNA在精子发生中的功能及机制”，2500万元（项目总经费）
5. 2018.1-2021.12国自然面上项目:“核基质相关长非编码RNA NMALT1对肝脏脂代谢及三维基因组的调控作用及机制研究”，60万元
6. 2018.12-2021.12重点研发计划项目：“精子发生的调节机制”，163万元
代表性论文(按时间排序；*通讯作者，#共同第一作者)
1.Ming H, Wang Q, Zhang Y, Ji L, Cheng L, Huo X, Yan Z, Dang Y and Wen B*. The nuclear bodies formed by histone demethylase KDM7A. Protein & Cell. 2020 Sep 16. doi: 10.1007/s13238-020-00783-x.
2.Ji L, Huo X, Zhang Y, Yan Z, Wang Q, Wen B*. TOPORS, a tumor suppressor protein, contributes to the maintenance of higher-order chromatin architecture. Biochim Biophys Acta Gene Regul Mech. 2020 May;1863(5):194518.
3.Huo X, Ji L, Zhang Y, Lv P, Cao X, Wang Q, Yan Z, Dong S, Du D, Zhang F, Wei G, Liu Y, Wen B*. The Nuclear Matrix Protein SAFB Cooperates with Major Satellite RNAs to Stabilize Heterochromatin Architecture Partially through Phase Separation. Molecular Cell. 2020 Jan 16;77(2):368-383.
4.Hu S, Lv P, Yan Z, Wen B*. Disruption of nuclear speckles reduces chromatin interactions in active compartments. Epigenetics Chromatin. 2019 Jul 17;12(1):43.
5.Sun Z, Zhu M, Lv P, Cheng L, Wang Q, Tian P, Yan Z, Wen B*. The Long Noncoding RNA Lncenc1 Maintains Naive States of Mouse ESCs by Promoting the Glycolysis Pathway. Stem Cell Reports. 2018. 11(3):741-755.
6.Fan H, Lv P, Huo X, Wu J, Wang Q, Cheng L, Liu Y, Tang QQ, Zhang L, Zhang F, Zheng X, Wu H, Wen B*. The nuclear matrix protein HNRNPU maintains 3D genome architecture globally in mouse hepatocytes. Genome Res. 2018 Feb;28(2):192-202.
7.Lin X, Han M, Cheng L, Chen J, Zhang Z, Shen T, Wang M, Wen B*, Ni T*, Han C*. Expression dynamics, relationships, and transcriptional regulations of diverse transcripts in mouse spermatogenic cells. RNA Biol. 2016 Oct 2;13(10):1011-1024.
8.Fu Y, Lv P, Yan G, Fan H, Cheng L, Zhang F, Dang Y, Wu H, Wen B*. MacroH2A1 associates with nuclear lamina and maintains chromatin architecture in mouse liver cells. Sci Rep. 2015 Nov 25;5:17186.
9.Wen B#, Wu H#, Loh YH#, Briem E, Daley GQ, Feinberg AP*. Euchromatin islands in large heterochromatin domains are enriched for CTCF binding and differentially DNA-methylated regions. BMC Genomics. 2012 13:566.
10.Doi A#, Park IH#, Wen B#, Murakami P, Aryee M, Irizarry R, Herb B, Ladd-Acosta C, Rho J, Loewer S, Miller J, Schlaeger T, Daley GQ* and Feinberg AP*. Differential methylation of tissue- and cancer specific CpG island shores distinguishes human induced pluripotent stem cells, embryonic stem cells and fibroblasts. Nature Genetics. 2009 41(12):1350-3.
11.Wen B, Wu H, Shinkai Y, Irizarry R and Feinberg AP*. Large histone H3 lysine-9 dimethylated chromatin blocks distinguish differentiated from embryonic stem cells. Nature Genetics. 2009. 41: 246-50 (Cover story).
12.Wen B#, Wu H#, Bjornsson H, Green RD, Irizarry R, Feinberg AP*. Overlapping euchromatin/heterochromatin- associated marks are enriched in imprinted gene regions and predict allele-specific modification. Genome Research. 2008. 18:1806-13.
13.Wen B, Li H, Gao S, Mao X, Gao Y, Li F, Zhang F, He Y, Dong Y, Zhang Y, Huang W, Jin J, Xiao C, Lu D, Chakraborty R, Su B, Deka R, Jin L*. Genetic structure of Hmong-Mien speaking populations in East Asia as revealed by mtDNA lineages. Mol Biol Evol. 2005. 22: 725-34.
14.Wen B, Li H, Lu DR, Song XF, Zhang F, He YG, Li F, Gao Y, Mao XY, Zhang L, Qian J, Tan JZ, Huang W, Deka R, Su B, Chakraborty R, Jin L*. Genetic Evidence Supports Demic Diffusion of Han Culture. Nature. 2004. 431: 302-5.
15.Wen B*, Xie X, Gao S, Li H, Shi H, Song X, Qian T, Xiao C, Jin J, Su B, Lu D, Chakraborty R, Jin L*. Analyses of genetic structure of Tibeto-Burman populations reveals sex-biased admixture in southern Tibeto-Burmans. Am. J. Hum. Genet. 2004. 74: 856-65.
主讲课程
《生物化学（二）》
《生物化学（二）》
《Biochemestry》
《医学分子生物学》