师资队伍

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何云刚

发布者:张弦发布时间:2023-04-30浏览次数:926

复旦大学生物医学研究院 青年研究员 课题组长

地址:徐汇区东安路 131号,科研二号楼,上海 200032

电子邮箱:heyungang@fudan.edu.cn

       从事计算基因组学和群体遗传学研究,关注生物表型的基因组基础,基因组多态性的群体与统计遗传学,和进化有关计算生物学问题等。发表论文40余篇,部分工作发表在Genome Res.,Mol Biol Evol.,Cell Res.,Proc. Natl. Acad. Sci. U S A.等重要期刊。主持国家自然科学基金委,中科院,上海市等资助的科研项目多项。获得教育部自然科学一等奖, 国家自然科学二等奖。

教育经历

  • 2002.9-2005.7复旦大学生命科学学院遗传研究所,遗传学,理学博士

  • 1999.9-2002.7 云南大学生命科学学院,分子生物学,理学硕士

  • 1995.9-1999.7 云南大学生命科学学院,微生物学,理学学士

工作经历

  • 2018.01-至今 复旦大学生物医学研究院,上海,青年研究员,课题组长。

  • 2008.08-2017.12 中国科学院计算生物学研究所,上海,助理研究员,副研究员

  • 2006.04-2008.04 斯坦福研究院(SRI) 健康科学中心,旧金山,博士后

主持科研项目

  • 上海市科委面上项目09ZR1437000,2009-2011

  • 中科院上海生科院领域前沿项目2010KIP206,2010-2012

  • 国家自然科学基金青年项目81100997,2012-2014

  • 国家自然科学基金面上项目31171279,2012-2015

  • 中国科学院支撑专项(青年创新促进会项目), 2012-2019

  • 国家自然科学基金重大研究计划培育项目91331109,2014-2016

  • 国家自然科学基金重大研究计划集成项目91731310,2018-2019

  • 国家自然科学基金面上项目31871255,2019-2022

部分论文

  1. Li H, Wang S, Zhong F, Bao W, Li Y, Liu L, Wang H, He Y. Age-Dependent Risks of Incidence and Mortality of COVID-19 in Hubei Province and Other Parts of China. Front Med (Lausanne). 2020 Apr 30;7:190. doi: 10.3389/fmed.2020.00190. eCollection 2020.

  2. Mo W#, Wang M#, Zhan R, Yu Y, He Y*, Lu H*. Kluyveromyces marxianus developing ethanol tolerance during adaptive evolution with significant improvements of multiple pathways. Biotechnol Biofuels. 2019 Mar 22;12:63. doi: 10.1186/s13068-019-1393-z. eCollection 2019.

  3. Dong H, Zhou B, Kang H, Jin W, Zhu Y, Shen Y, Sun J, Wang S, Zhao G, Hou J, He Y. Small surface antigen variants of HBV associated with responses to telbivudine treatment in chronic hepatitis B patients. Antivir Ther. 2017;22(1):43-51. doi: 10.3851/IMP3078. Epub 2016 Sep 1.

  4. Xu H#, Yang Y#, Wang S, Zhu R, Qiu T, Qiu J, Zhang Q, Jin L, He Y*, Tang K*, Cao Z*. Predicting the Mutating Distribution at Antigenic Sites of the Influenza Virus. Sci Rep. 2016 Feb 3;6:20239. doi: 10.1038/srep20239.

  5. He Y, Wang M, Huang X, Li R, Xu H, Xu S, Jin L. A probabilistic method for testing and estimating selection differences between populations. Genome Res. 2015 Oct 13. pii: gr.192336.115.

  6. Wang M, Huang X, Li R, Xu H, Jin L, He Y. Detecting Recent Positive Selection with High Accuracy and Reliability by Conditional Coalescent Tree. Mol Biol Evol. 2014 31(11):3068-3080.

  7. He Y, Wang WR, Xu S, et al. Paleolithic Contingent in Modern Japanese: Estimation and Inference using Genome-wide Data. Sci Rep. 2012 Apr;2:355

  8. He Y, Xu S, Jia C, Jin L. A design of multi-source samples as a shared control for association studies in genetically stratified populations. Cell Res. 2009 Jul;19(7):913-915

  9. He Y*, Jiang R, Fu W, Bergen AW, Swan GE, Jin L.. Correlation of Population Parameters Leading to Power Differences In Association Studies with Population Stratification. Ann Hum Genet. 2008 72:801-811

  10. Huang W#*, He Y#, Wang H#, Wang Y#, Liu Y, Wang Y, Chu X, Wang Y, Xu L, Shen Y, Xiong X, Li H, Wen B, Qian J, Yuan W, Zhang C, Wang Y, Jiang H, Zhao G, Chen Z*, Jin L*. Linkage disequilibrium sharing and haplotype-tagged SNP portability between populations. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2006, 103: 1418-1421

  11. The International HapMap Consortium. A haplotype map of the human genome. Nature 2005, 437: 1299-1320