药理学系各研究团队累计已承担国家基础研究重大项目973、国家重点研发计划、“脑科学与类脑研究”重大项目、国家自然科学基金委项目(重点、国家杰出青年、重点国际合作、创新群体、面上项目等)、国家"新药创制重大专项"、上海市领军人才计划、上海市科委重点、重点攻关及优秀学科带头人等国家及上海市生物医药领域科技支撑项目纵向项目等50多项,同时承担国际政府间合作基金,国内外制药企业委托服务等多个科研项目。